2024 Nobel Kimya Ödülü: AlphaFold2 ve Yeni Protein Tasarımı

2024 Nobel Kimya Ödülü: AlphaFold2 ve Yeni Protein Tasarımı - RayHaber
2024 Nobel Kimya Ödülü: AlphaFold2 ve Yeni Protein Tasarımı - RayHaber

2024 Nobel Kimya Ödülü’nde Dönüm Noktası Çalışmalar

2024 Nobel Kimya Ödülü: AlphaFold2 ve Yeni Protein Tasarımı - RayHaber

Uzmanlar, 2024 Nobel Kimya Ödülü’nü kazandıran çalışmaların detaylarını ve bu gelişmelerin potansiyel sonuçlarını CNN’e değerlendirdi. İsveç’teki Karolinska Enstitüsü’nde Tıbbi Genetik Profesörü ve İsveç Kraliyet Bilimler Akademisi üyesi olan Anna Wedell, bu seneki ödülü kazandıran “protein yapı tahmini” konusundaki araştırmaların, kimya alanında bir dönüm noktası olduğunu vurguladı. Wedell, Demis Hassabis ve John Jumper’ın geliştirdiği AlphaFold2 yapay zeka modelinin, 200 milyon proteinin neredeyse tamamının yapısını tahmin etme yeteneğine sahip olduğunu ve bu modelin tüm araştırmacıların kullanımına açıldığını belirtti.

Bu gelişmelerin kendisi için de önemli olduğunu ifade eden Wedell, nadir hastalıklar üzerine yaptığı çalışmalarda AlphaFold2 modelinden faydalandığını kaydetti. Bu modelin, farklı alanlarda büyük sıçramalara ve ilerlemelere yol açabileceğini dile getirdi.

Clarivate’in Bilimsel Bilgi Enstitüsü’nden Araştırma Analizi Başkanı David Pendlebury, Hassabis ve Jumper’ın makalesine 16 binden fazla atıf yapılmasını, “eşine az rastlanır bir durum” olarak tanımlayarak, bu çalışmanın devrim niteliğindeki etkisinin altını çizdi. Pendlebury, 61 milyon bilimsel makaleden sadece yaklaşık 500’ünün 10 binden fazla atıf aldığını belirterek, yapay zekanın araştırma alanındaki dönüşümsel etkisinin hem fizik hem de kimya dalında üst üste ödül almasının “benzersiz” olduğunu ifade etti.

Dünyanın en eski bilimsel akademisi olan Kraliyet Topluluğu’nun başkanı Adam Smith, AlphaFold’un geliştiricilerine verilen ödülün, “yapay zekanın bilimdeki dönüştürücü rolünün açık bir şekilde tanındığını” gösterdiğini söyledi. Smith, “Demis, alanın öncü araştırmacılarından biri olmasının yanı sıra, bilimin büyük zorluklarının üstesinden gelebilecek ve toplum için faydalı olacak bir yapay zeka vizyonunu savundu.” şeklinde ifade etti.

AlphaFold2 ve Önemi

AlphaFold2, Nature dergisinde yayımlanan bir makaleye göre, Google’ın yapay zeka şirketi DeepMind çatısı altında geliştirilmiş bir yapay zeka modelidir. Bu model, amino asit dizilerinden proteinlerin üç boyutlu yapılarını tahmin etme yeteneğine sahiptir. Protein yapısının tahmini, biyoloji ve kimya alanında en zorlu problemlerden biri olarak kabul ediliyor ve bilim insanları bu alanda 50 yılı aşkın süredir çalışmaktadır. AlphaFold2’nin geliştirilmesi, protein yapısı tahmininde “benzeri görülmemiş” bir ilerleme sağlamaktadır.

Bu yapay zeka modeli sayesinde, 200 milyondan fazla proteinin yapısının tahmin edilip yayınlanması, özellikle biyoloji ve tıp alanlarında büyük bir heyecan yaratmıştır. AlphaFold2’nin yapısal biyoloji, ilaç keşfi, protein tasarımı ve protein fonksiyonunun tahmini gibi alanlarda önemli bir etkisi olacağı düşünülmektedir. 2021’de geliştirilen bu model, halihazırda biyoloji ve tıp alanlarında birçok araştırmaya ilham vermektedir.

David Baker ve Yeni Proteinler

2024 Nobel Kimya Ödülü’nün ikinci yarısı ise yeni işlevlere sahip proteinler tasarlayan David Baker‘a verildi. Washington Üniversitesi Protein Tasarımı Enstitüsü Başkanı olan Baker, bilgisayar programını önce “protein yapılarını yeni boyutlarda çizmek” için, ardından da “bu yapıyı elde etmek için gereken amino asit dizisini bulmak” amacıyla kullandığını belirtti. Nobel komitesi üyesi Johan Aqvist, Baker’ın oluşturduğu protein çeşitliliğinin “kesinlikle akılalmaz” olduğunu ifade ederek, “Bu teknolojiyle artık neredeyse her tür proteini inşa edebiliyorsunuz gibi görünüyor.” dedi.

2024 Nobel Kimya Ödülleri Açıklandı

2024 Nobel Kimya Ödülü: AlphaFold2 ve Yeni Protein Tasarımı - RayHaber

İsveç Kraliyet Bilimler Akademisi, dün, 2024 Nobel Kimya Ödülü’nün “yarısının” “bilgi-işlemsel protein tasarımı” alanındaki çalışmaları nedeniyle ABD’li David Baker’a, diğer “yarısının” ise “protein yapı tahmini” konusundaki araştırmaları dolayısıyla İngiliz Demis Hassabis ve ABD’li John Jumper’a verildiğini açıkladı. Akademiden yapılan açıklamada, David Baker’ın “daha önce var olmayan ve çoğu durumda tamamen yeni işlevlere sahip proteinler inşa ettiği” belirtilirken, Demis Hassabis ve John Jumper’ın “kimyacıların 50 yılı aşkın süredir çözmeye çalıştığı bir sorunu yapay zeka kullanarak çözdüğü” ifade edildi. Ayrıca, bir amino asit dizisinden bir proteinin üç boyutlu yapısını tahmin eden Hassabis ve Jumper’ın geliştirdiği AlphaFold2 modeli sayesinde “bilinen 200 milyon proteinin neredeyse tamamının yapısının tahmin edilebildiği” vurgulandı.

Demiryolu Manşetleri

Vietnam’da Hue-Da Nang Hattında Buharlı Tren İçin Deneme Seferi Hazırlığı - RayHaber
84 Vietnam

Vietnam’da Hue-Da Nang Hattında Buharlı Tren İçin Deneme Seferi Hazırlığı

Vietnam’da turizm odaklı demiryolu taşımacılığını geliştirmek amacıyla Hue ile Da Nang arasında buharlı lokomotif işletilmesi için yeni bir adım atıldı. Hue kentinin yöneticileri ile Vietnam Ulusal Demiryolu Şirketi (VNR), 17 Eylül’de Hanoi’de bir araya gelerek tarihi güzergâhta buharlı tren işletme planını görüştü. Toplantıda, Mart 2024’ten bu yana hizmet veren Hue-Da 🚆
New York 2. Cadde Metrosu’nda Son Sözleşme İçin Teklif Süreci Başladı - RayHaber
1 Amerika

New York 2. Cadde Metrosu’nda Son Sözleşme İçin Teklif Süreci Başladı

New York’taki İkinci Cadde Metrosu’nun 2. Aşaması için son büyük inşaat sözleşmesi teklif sürecine girdi. Metropolitan Transportation Authority (MTA), mevcut 1. Aşama bölümünü de kapsayacak şekilde iletişim tabanlı tren kontrolü (CBTC) sinyalizasyon sisteminin kurulmasını içeren 4 numaralı sözleşme için nihai teklif talebini yayımladı. MTA’nın 14 Eylül’de yaptığı duyuruya göre kurum, 🚆
Union Pacific’in Big Boy’u Tatil Turuna Çıkıyor: Biletler 16 Ekim’de Satışta - RayHaber
1 Amerika

Union Pacific’in Big Boy’u Tatil Turuna Çıkıyor: Biletler 16 Ekim’de Satışta

Union Pacific’in efsanevi 4014 numaralı Big Boy buharlı lokomotifi, ilk tatil turu kapsamında kasım ayında Wyoming’in Cheyenne kentinden Denver bölgesine yolcu vagonlarıyla sefer yapacak. Biletli yolcuların katılabileceği özel tur, Make-A-Wish Foundation of America’ya destek sağlamak amacıyla düzenlenecek. Union Pacific tarafından 17 Eylül 2026’da duyurulan programa göre Big Boy No. 4014, 🚆
Alstom, Wellington’ın Yeni Bataryalı Trenlerini Toplumla Birlikte Tasarlıyor - RayHaber
67 Yeni Zelanda

Alstom, Wellington’ın Yeni Bataryalı Trenlerini Toplumla Birlikte Tasarlıyor

Alstom, Yeni Zelanda’nın Wellington bölgesinde hizmet vermesi planlanan Tūhono bataryalı elektrikli trenlerin tasarım çalışmalarını sürücüler ve yerel topluluk temsilcileriyle birlikte yürütüyor. Henüz erken tasarım aşamasında bulunan trenlerin ilk partisinin 2028 yılının ortalarında Yeni Zelanda’ya teslim edilmesi planlanırken, yolcu ve sürücü deneyimlerinden alınan geri bildirimlerin araçların nihai tasarımına yansıtılması hedefleniyor. Alstom 🚆
NJ Transit’ten Beş Haftalık Sefer Düzenlemesi - RayHaber
1 Amerika

NJ Transit’ten Beş Haftalık Sefer Düzenlemesi

ABD’nin New Jersey eyaletindeki Portal Kuzey Köprüsü projesinde son rayın yeni köprüye aktarılması için geçiş süreci başlıyor. Amtrak ve NJ Transit’in 9 Ekim’de başlamayı planladığı çalışmalar nedeniyle NJ Transit, 11 Ekim’den itibaren yaklaşık beş hafta boyunca sefer programlarında kapsamlı değişiklikler yapacak. Geçiş tamamlandığında New York’a giden ve New York’tan gelen 🚆
SJ, Stockholm-Duved Gece Trenini 2031’e Kadar İşletebilecek - RayHaber
46 İsveç

SJ, Stockholm-Duved Gece Trenini 2031’e Kadar İşletebilecek

İsveç demiryolu şirketi SJ, Trafikverket ile imzaladığı yeni sözleşme kapsamında Stockholm ile Östersund üzerinden Duved arasında işletilen gece treni hizmetini sürdürmeye devam edecek. İlk aşamada altı aylık süreyi kapsayan anlaşma, 13 Aralık 2026 ile 13 Haziran 2027 döneminde geçerli olacak. Trafikverket’in uzatma seçeneklerini kullanması halinde SJ’nin bu hatta işletmeciliği Aralık 🚆
Nexrail’den 20 Yeni Hibrit Lokomotif Siparişi: Filo 50’ye Çıkacak - RayHaber
352 Lüksemburg

Nexrail’den 20 Yeni Hibrit Lokomotif Siparişi: Filo 50’ye Çıkacak

Lüksemburg merkezli lokomotif kiralama şirketi Nexrail, Vossloh Rolling Stock’tan 20 adet daha DE18 Smart Hybrid lokomotif sipariş etti. 2027 yılında teslim edilmesi planlanan yeni lokomotiflerle şirketin hibrit lokomotif filosunun 50 adede ulaşması bekleniyor. Yeni araçlar, mevcut modellere kıyasla daha geniş bir onay paketiyle Fransa, Belçika, Lüksemburg ve Almanya’da kullanılabilecek. Nexrail, 🚆
InnoTrans 2026’da Otonom Ulaşım ve Robotik Teknolojiler Öne Çıkıyor - RayHaber
49 Almanya

InnoTrans 2026’da Otonom Ulaşım ve Robotik Teknolojiler Öne Çıkıyor

Berlin’de 22-25 Eylül 2026 tarihleri arasında düzenlenecek InnoTrans 2026 öncesinde, fuarın geleceğin toplu taşıma teknolojilerine ilişkin önemli bir vitrin olması bekleniyor. 2013 yılından bu yana organizasyonun direktörlüğünü yürüten Kerstin Schulz, önümüzdeki 5 ila 10 yıllık dönemde özellikle otonom toplu taşımanın öneminin artacağını öngörüyor. İlk kez 1996’da 172 katılımcıyla düzenlenen fuarda 🚆
Demiryolu Yolcuları Birliği’nden UP-NS Birleşmesine İtiraz - RayHaber
1 Amerika

Demiryolu Yolcuları Birliği’nden UP-NS Birleşmesine İtiraz

Union Pacific (UP) ile Norfolk Southern (NS) arasındaki birleşme başvurusu, yolcu demiryolu hizmetlerinin geleceğine ilişkin kapasite endişeleri nedeniyle yeni bir itirazla karşı karşıya kaldı. Demiryolu Yolcuları Birliği’nin incelemesine göre Amtrak’ın mevcut 53 güzergah çifti ve hat segmentinin 42’sinde birleşme sonrasında yük trafiğinde artış öngörülüyor. Birlik, 9 Eylül’de sunduğu görüşlerde iki 🚆